Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pard6bQ9JK83 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pard6bQ9JK83 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms