Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msgn1Q9JK54 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msgn1Q9JK54 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms