Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra4Q9JJT2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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