Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Efcc1Q9JJF6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Efcc1Q9JJF6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Efcc1Q9JJF6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms