Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smad9Q9JIW5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smad9Q9JIW5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms