Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmbr1Q9JIT0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbr1Q9JIT0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms