Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnmb4Q9JIN6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms