Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl28Q9JIL2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl28Q9JIL2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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