Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms