Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tssc4Q9JHE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tssc4Q9JHE7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms