Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc28a3Q9ERH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms