Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb3Q9ERD7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms