Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slco1c1Q9ERB5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms