Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp4Q9ER80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtp4Q9ER80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms