Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhojQ9ER71 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhojQ9ER71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhojQ9ER71 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhojQ9ER71 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhojQ9ER71 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhojQ9ER71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms