Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clstn2Q9ER65 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms