Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn4aQ9ER60 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn4aQ9ER60 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms