Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Capn12Q9ER56 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms