Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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