Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnn1Q9EQR3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms