Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pold3Q9EQ28 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pold3Q9EQ28 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms