Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlr1Q9EPQ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms