Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpr88Q9EPB7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpr88Q9EPB7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms