Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdf2Q9DCT5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdf2Q9DCT5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms