Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop7Q9DCH2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms