Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmpcaQ9DC61 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms