Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmg20aQ9DC33 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmg20aQ9DC33 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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