Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms