Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Swt1Q9DBQ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Swt1Q9DBQ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms