Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smg9Q9DB90 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smg9Q9DB90 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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