Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pop5Q9DB28 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms