Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms