Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sgf29Q9DA08 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms