Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdzd9Q9D9M4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd9Q9D9M4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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