Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem41aQ9D8U2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms