Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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SlirpQ9D8T7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SlirpQ9D8T7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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