Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Alkbh4Q9D8F1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Alkbh4Q9D8F1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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