Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifi35Q9D8C4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifi35Q9D8C4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms