Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2af1Q9D883 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2af1Q9D883 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms