Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Cldn22Q9D7U6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Cldn22Q9D7U6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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