Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmigd1Q9D7L8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms