Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Capns2Q9D7J7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms