Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk3bl1Q9D701 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms