Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc94Q9D6J3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms