Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms