Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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