Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms