Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gcc1Q9D4H2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gcc1Q9D4H2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms