Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms