Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syce1Q9D495 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syce1Q9D495 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms